计划复制50份高影响力的癌症论文缩小到18岁

计划复制50份高影响力的癌症论文缩小到18岁
DAVIDE BONAZZI
计划复制50份高影响力的癌症论文缩小到18岁

一项雄心勃勃的项目,近5年前开始复制50篇高影响力癌症生物学论文的实验,但逐渐缩小这一数字,现在预计只完成18项研究。

“我希望我们可以做得更多,”生物学家Tim Errington说道,他是弗吉尼亚州夏洛茨维尔开放科学中心的项目负责人。 但是,他补充说,“在你做这样的项目之前,有一个不能真正理解它是多么具有挑战性的因素。”

重复性项目:癌症生物学(RP:CP) 作为一项公开努力来测试可复制性,因为两家制药公司报告称他们在复制许多癌症研究时遇到了麻烦。 这项工作是与位于加利福尼亚州帕洛阿尔托的公司Science Exchange合作,该公司找到了合同实验室,从每篇论文中重现了一些关键实验。 资金包括Laura和John Arnold基金会提供的130万美元赠款,每项研究的费用约为25,000美元。 实验预计需要1年。

该项目很快引起了原始研究的作者和其他人的批评,他们担心复制研究将不可避免地失败,因为合同实验室缺乏复制工作所需的专业知识。

随着组织者意识到成本上升和延迟随之而来; 同意审查提议的复制的决定也增加了时间。 组织者将论文列表削减 ,然后削减 。 Errington说,在过去的几个月里,他们决定停止38%或11次正在进行的复制。 (科学交流中心主席Elizabeth Iorns表示,18项完成的研究的总费用平均约为60,000美元,其中包括两个高价的“异常值”。)

Errington说,削减一些复制的一个原因是,为了获得有意义的结果而进行故障排除或优化实验花费的时间太长。 例如,确定实验所需的细胞密度需要测试一系列细胞密度。 虽然“这些事情在实验室中自然发生,”Errington说,如果原始论文中包含方法学细节,这项工作可能会更快。 该项目还花费了大量时间来获得或重新制作试剂,例如细胞系和质粒(插入细胞中的DNA),这些试剂是原始实验室无法获得的。

努力的教训之一:披露更多的协议细节,并直接从原始实验室或通过Addgene等服务免费提供材料,这将加快科学家在其他人工作的基础上的能力。 “沟通和分享是我们可以努力改进的低成果,”Errington说。 Iorns补充说,另一个问题是,学术实验室很少验证他们的分析,因此很难知道阳性结果是真实的还是“只是噪音”。

该项目已经发布 。 底线是混合的:五个大部分是可重复的,三个是不确定的,两个研究是否定的,但最初的发现已得到其他实验室的证实。 事实上,最初的50篇论文中有许多已被其他团体证实,正如一些RP:CB的批评者指出的那样。

RP:CB团队现在正在撰写剩下的八项已完成的研究以及该项目的荟萃分析和总结。 Errington说,11项不完整的研究将以简短的形式发表,仍然“具有很多价值,但不如完成的复制品那么多”。